可能です。
Run Control画面やI/O Channels: Import画面、I/O Channels: Export画面の黄色欄にVS Commandを用いて新規変数を定義することで作成できます。作成した変数は外部モデルとのやり取りやPlot表示（出力変数のみ）などに使用することができます。
以下に設定例を示します。

＜新規入力変数の設定例＞
黄色欄に以下を設定

※ ① 入力変数名
    ② expression（式）
    ③ units（単位）
    ④ description（説明）
    expression、units、descriptionの設定は任意です。
    入力変数には接頭辞「IMP_」が必要です。

＜新規出力変数の設定例＞
黄色欄に以下を設定

※ ① 出力変数名
    ② expression（式）
    ③ units（単位）
    ④ long_name（出力変数の詳細名）
   units、long_nameの設定は任意です。
   expression（式）には計算式や数値、変数名などを設定してください。
   （expressionが指定されていない場合はデフォルト値0が設定されます。）

詳細は、Reference Manuals > VS Commandsドキュメントをご参照ください。